Danganronpa 3: The End Of Kibougamine Gakuen Mirai Hen vietsub Thế giới đang đến gần với sự hủy diệt bởi Ultimate Despair – người đã gây ra tấm thảm kịch kinh khủng nhất, tàn khốc nhất, tồi tệ nhất và lớn nhất trong thế giới loài người. Để cứu thế giới thoát khỏi đống hỗn độn ấy, FF – “Tổ chức tương lai” đã được thành lập. Tồi tệ hơn, trong số những thành viên đó, có một kẻ phản bội thực thụ, muốn giết hết những thành viên của FF. Naegi bị buộc phải đối mặt với thử thách chết chóc cuối cùng: giết, hoặc bị giết.
Câu chuyện về nỗi tuyệt vọng bắt đầu khi niềm hy vọng sẽ giết chết chính nó.